Getragen wird das Kunstforum Ostdeutsche Galerie von einer gleichnamigen Stiftung, die 1966 auf der Grundlage des Kulturparagraphen im Bundesvertriebenen- und Flüchtlingsgesetz (§ 96 BVFG) gegründet wurde. 1970 bezog das Museum ein eigenes Domizil in der erweiterten Jugendstil-Kunsthalle im Stadtpark von Regensburg. Seit 1980 umfasst das attraktive Museumsensemble vier Baukomplexe mit einer Ausstellungsfläche von 2.500 Quadratmetern. Als Träger der Stiftung fungieren heute die Bundesrepublik Deutschland, die Stadt Regensburg und der Freistaat Bayern.

Kernaufgabe der Stiftung ist, das Kunsterbe und die fortwirkende kreative Substanz der ehemals deutsch geprägten Kulturräume im Osten (Böhmen, Mähren, Schlesien, Ost- und Westpreußen) zu bewahren und für das Europa von heute und morgen fruchtbar zu machen.

Die Stiftung wird durch zwei Gremien repräsentiert.